新四军在皖南事变后的主力部队之一。1941年2月由活动在苏南的新四军部队改编。师长兼政治委员谭震林，参谋长罗忠毅。在茅山地区的第2支队改编为第16旅，在东路地区的第3支队(原江南抗日救国军)改编为第18旅，另辖江南保安司令部，后又成立苏南第4、第5、第6行政区保安司令部，共8000余人。3月，第16旅在太滆地区歼日伪军200余人。5月在谭震林指挥下，第16旅击退国民党顽固派军队第40师连续三次进攻f歼顽军300余人。7月，第18旅进行反"清乡"斗争，以一部兵力留在内线坚持，主力转移到外线作战。但由于缺乏反"清乡"斗争经验，留在内线坚持的部队和党、政干部遭到较大损失。10月，第18旅北渡长江，执行开辟江(都)高(邮)宝(应)地区的新任务，并于11月调归第1师建制。第16旅为配合第l 8旅地区反"清乡"斗争，从7月至11月，先后攻克延凌、九里等日伪军据点30余处。11月28日，师参谋长兼第16旅旅长罗忠毅、旅政治委员廖海涛牺牲。12月上旬，第6师师部率警卫团等北渡长江，进入江高宝地区。1942年3月16日，中共中央军委任命第6师师长兼政治委员谭震林为第l师政治委员，并决定第6师部队归第l师统一指挥，番号不变。7月，第16旅击退国民党顽军2000余人的进攻，巩固了深阳、深水地区。lO月26日，中共中央军委决定第l、第6师领导机关对内实行合并，由第1师师长粟裕统一指挥，对外师、旅原番号不变。1943年1月16日，从苏中南下到达苏南丹阳的第l师第2旅与第16旅合编，仍称第16旅。1945年1月，第16旅改编为苏浙军区第1纵队。